Good Governance merupakan suatu proses yang digunakan oleh organisasi suatu instansi untuk memberikan nilai tambah pada instansi secara berkesinambungan dalam jangka panjang bagi pemimpin instansi dengan memperhatikan stakeholder. Penelitian ini bertujuan untuk menguji pengaruh Sistem Pengendalian Intern, dan Implementasi Sistem Akuntabilitas Kinerja Instansi Pemerintah terhadap penerapan Good Governance di Kantor BKD Kabupaten Pati.
Jenis penelitian ini yaitu penelitian kualitatif dengan data primer. Populasi pada Kantor BKD Kabupaten Pati dengan pemilihan sampel menggunakan metode purposive sampling dan sampel yang digunakan sebanyak 35 responden. Metode analisis dari penelitian ini menggunakan regresi berganda dan regresi sederhana program SPSS 23.
Hasil penelitian disimpulkan bahwa Sistem Pengendalian Intern berpengaruh positif dan signifikan terhadap penerapan Good Governance. Sistem Akuntabiltas Kinerja Instansi Pemerintah (SAKIP) berpengaruh positif dan signifikan terhadap Good Governance.

Kata Kunci : Sistem Pengendalian Intern, Sistem Akuntabilitas Kinerja Instansi Pemerintah (SAKIP), Good Governance